More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1855 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1855  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0321783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0285  30S ribosomal protein S7  85.81 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000325216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  83.87 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  83.87 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  81.94 
 
 		 155 aa  255  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2068  30S ribosomal protein S7  71.61 
 
 		 155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000773315  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2300  30S ribosomal protein S7  73.68 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000109859  decreased coverage  0.000727759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 157 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  59.59 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  184  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032235  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  54.05 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  59.44 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04527  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000390925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0199  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000133398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2186  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 157 aa  177  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  decreased coverage  0.00846065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0274  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  hitchhiker  0.00000162454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  59.59 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0269  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000299452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1896  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 157 aa  176  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118466  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  54.05 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  59.44 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  54.05 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  54.48 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  52.7 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  54.73 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  52 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  54.25 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  53.38 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  53.1 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>