More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0400 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 158 aa  327  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  86.08 
 
 		 158 aa  294  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  82.91 
 
 		 158 aa  284  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 155 aa  224  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 155 aa  221  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  66.46 
 
 		 155 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 155 aa  214  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  62.03 
 
 		 155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  60.76 
 
 		 158 aa  210  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  56.33 
 
 		 155 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  53.16 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  180  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  180  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  51.9 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  50.63 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  54.14 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  48.73 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  49.37 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0322  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.332959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2020  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>