More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4448 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  81.29 
 
 		 155 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  78.71 
 
 		 155 aa  263  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  74.19 
 
 		 155 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 158 aa  222  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 158 aa  216  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  62.03 
 
 		 158 aa  212  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  60.81 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  54.84 
 
 		 155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  54.84 
 
 		 155 aa  187  5.999999999999999e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3999  ribosomal protein S7  55.86 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000436964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  54.37 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  54.84 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 158 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>