More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1941 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 158 aa  327  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 155 aa  220  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 155 aa  219  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  62.66 
 
 		 158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  60.76 
 
 		 158 aa  210  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  62.66 
 
 		 155 aa  208  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  60.13 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  54.43 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  54.43 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  54.43 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  54.43 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  56.95 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  56.33 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  55.7 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  51.9 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  55.63 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  50.63 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  51.9 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  56.96 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  58.28 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  56.96 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  50.63 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  57.62 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  56.29 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  56.29 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  56.29 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  56.29 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  54.97 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  56.29 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  51.27 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  51.27 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  51.27 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  54.3 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  54.97 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  52.32 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  54.97 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  49.04 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  54.97 
 
 		 157 aa  174  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  55.63 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  50.63 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  49.04 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  54.3 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  54.97 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>