More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3165 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  80 
 
 		 155 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  78.71 
 
 		 155 aa  263  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  78.06 
 
 		 155 aa  262  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  67.09 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  66.46 
 
 		 158 aa  226  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 		 155 aa  221  4e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 158 aa  220  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  64.52 
 
 		 155 aa  215  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  52.9 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 155 aa  193  8.000000000000001e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  55.62 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3999  ribosomal protein S7  55.86 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000436964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  58.78 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>