More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1607 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  320  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  68.99 
 
 		 158 aa  225  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  67.1 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  66.46 
 
 		 158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 158 aa  216  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  64.52 
 
 		 155 aa  215  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 155 aa  213  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  210  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3999  ribosomal protein S7  56.94 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000436964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  56.96 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  53.59 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  53.59 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  53.59 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  53.59 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  49.02 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  53.59 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  54.9 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  54.25 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  173  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  173  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 157 aa  173  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  50.65 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  56.25 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  49.67 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  52.94 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  49.02 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  49.02 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  47.71 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  49.02 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  49.02 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  48.37 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  49.67 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  47.71 
 
 		 156 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  47.71 
 
 		 156 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  48.7 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  48.7 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  50.65 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  47.71 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  50.98 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  50.65 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  49.67 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0448  30S ribosomal protein S7  49.66 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307427  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0322  30S ribosomal protein S7  48.37 
 
 		 156 aa  166  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.332959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  48.37 
 
 		 156 aa  166  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  45.75 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  50.65 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_414  ribosomal protein S7  49.66 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  52.29 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16331  30S ribosomal protein S7  48.37 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  50.65 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  50.33 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>