More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2829 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  73.26 
 
 		 197 aa  296  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  69.57 
 
 		 204 aa  285  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  70.81 
 
 		 204 aa  278  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  62.89 
 
 		 194 aa  264  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  59.02 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  57.38 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  55.74 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  52.33 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  52.46 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  52.46 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  52.17 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  50.82 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  48.37 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  52.17 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  49.46 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 		 188 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  50.82 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  46.74 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  48.09 
 
 		 193 aa  177  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  47.83 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  46.74 
 
 		 223 aa  176  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  46.74 
 
 		 224 aa  176  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  47.28 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  45.6 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  44.02 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  44.02 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  42.93 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  41.4 
 
 		 225 aa  153  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  41.67 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40.86 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  38.06 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  34.31 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  31.58 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  33.57 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  34.29 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  34.33 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  34.29 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  31.54 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  33.57 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  32.84 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  35.71 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  33.85 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  31.54 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  31.43 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  31.69 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  36.43 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  32.87 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  32.17 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  30.77 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  32.09 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  34.56 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  30.28 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  33.57 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  34.33 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>