More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1189 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  98.09 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  83.44 
 
 		 157 aa  273  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 		 157 aa  230  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  65.81 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  195  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  62.5 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  62.5 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  58.55 
 
 		 155 aa  190  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  56.58 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_414  ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_002936  DET0471  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000140142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0448  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307427  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0722  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0592773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  55.92 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  57.89 
 
 		 155 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  176  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  55.84 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0261  30S ribosomal protein S7  53.8 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>