More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1931 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  67.86 
 
 		 223 aa  341  5e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  68.75 
 
 		 223 aa  341  5.999999999999999e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  68.95 
 
 		 224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  67.56 
 
 		 224 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  62.18 
 
 		 200 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  60.54 
 
 		 193 aa  250  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  52.58 
 
 		 194 aa  226  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  50.81 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  47.54 
 
 		 186 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  45.08 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  45.36 
 
 		 202 aa  188  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  46.03 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  45.9 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 		 185 aa  185  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  47.31 
 
 		 188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  47.31 
 
 		 188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  47.85 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  46.77 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  45.11 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  45.65 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  45.54 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  44.09 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  45.55 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.7 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  40.1 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  46.2 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  44.39 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  42.08 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  46.74 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  41.18 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  43.07 
 
 		 156 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  43.61 
 
 		 156 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.5  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  38.64 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  39.39 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  35.54 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  35.81 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  38.35 
 
 		 156 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  41.32 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  35.54 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  35.54 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  36.55 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  36.84 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  33.73 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  34.34 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  34.34 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  36.84 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  36.59 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  39.1 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  33.73 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  34.34 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  37.21 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  37.21 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  35.34 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  34.09 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>