More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2206 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  76.88 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  66.18 
 
 		 204 aa  286  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  73.26 
 
 		 194 aa  278  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  64.67 
 
 		 194 aa  252  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  63.93 
 
 		 185 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  60.11 
 
 		 186 aa  237  8e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  58.47 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  55.15 
 
 		 202 aa  224  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  57.38 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  57.61 
 
 		 217 aa  221  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  55.67 
 
 		 202 aa  220  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  55.74 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  53.26 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  53.26 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  52.72 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  51.63 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  53.8 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 		 188 aa  200  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  51.91 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  47.83 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 		 224 aa  185  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  45.11 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  47.83 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  47.54 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  43.48 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.01 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  44.44 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  41.12 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  41.4 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  39.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  35.82 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  35.71 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  37.04 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  34.33 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  35 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  35.07 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  34.62 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  32.85 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  37.14 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  34.62 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  35.38 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  34.04 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  35 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  33.85 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  33.85 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  33.85 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  34.62 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  32.14 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  31.69 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  32.14 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>