More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_2007 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 
224 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  87.5 
 
 
224 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  91.44 
 
 
223 aa  426  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  88.29 
 
 
223 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  67.56 
 
 
234 aa  335  2.9999999999999997e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  66.84 
 
 
200 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  67.76 
 
 
193 aa  263  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  62.3 
 
 
194 aa  242  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  56.52 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  49.01 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  50.52 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
188 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  51.09 
 
 
188 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
188 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  48.63 
 
 
185 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
188 aa  189  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  50.54 
 
 
194 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  48.79 
 
 
215 aa  188  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  48.63 
 
 
202 aa  188  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  51.63 
 
 
228 aa  185  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 
197 aa  185  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 
188 aa  185  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  46.45 
 
 
202 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  47.31 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  45.16 
 
 
204 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  43.72 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  47.28 
 
 
204 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  45.11 
 
 
204 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  38.91 
 
 
217 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  44.57 
 
 
194 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  47.28 
 
 
194 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  42.34 
 
 
156 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  89  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 
155 aa  88.6  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  41.61 
 
 
156 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 
155 aa  88.6  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 
156 aa  88.2  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 
156 aa  88.2  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  42.34 
 
 
156 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  39.71 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  39.31 
 
 
156 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  41.18 
 
 
156 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
156 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  39.42 
 
 
155 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  34.51 
 
 
155 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  40.44 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  37.95 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  35.54 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  39.71 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  37.35 
 
 
156 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
155 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  37.23 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  42.98 
 
 
156 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  36.75 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  36.14 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  34.94 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  42.15 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  37.5 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  42.98 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  36.14 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  42.98 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  42.15 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  42.15 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  39.71 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  42.15 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  34.94 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  38.97 
 
 
157 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>