More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3276 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
157 aa  320  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 
157 aa  230  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 
157 aa  229  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
157 aa  222  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  59.62 
 
 
157 aa  198  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  197  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  53.29 
 
 
155 aa  184  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  184  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  51.32 
 
 
155 aa  184  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
156 aa  183  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  52.63 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  52.63 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0722  30S ribosomal protein S7  54.84 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0592773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  180  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_414  ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  180  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  179  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0448  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  179  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0471  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  178  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000140142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  177  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  176  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  176  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
156 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  174  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
156 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  53.55 
 
 
157 aa  174  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  50.65 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  53.5 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  48.7 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  50 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
156 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  51.3 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  56.96 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  170  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  52.6 
 
 
156 aa  168  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 
156 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  52.63 
 
 
155 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>