More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2384 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  76.47 
 
 		 204 aa  320  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  73.76 
 
 		 202 aa  314  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  73.27 
 
 		 202 aa  312  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  67 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  59.78 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  55.98 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  53.85 
 
 		 197 aa  217  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  53.26 
 
 		 186 aa  214  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 204 aa  207  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  55.19 
 
 		 204 aa  207  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  51.63 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  52.72 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  51.37 
 
 		 187 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  48.69 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  49.18 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  47.64 
 
 		 194 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  52.46 
 
 		 194 aa  191  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  45.36 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  48.63 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  48.65 
 
 		 188 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  48.65 
 
 		 188 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  48.11 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  47.57 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  45.41 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.98 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  44.39 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  43.37 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  42.05 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  43.15 
 
 		 199 aa  158  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 155 aa  62  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  27.74 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  29.32 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  28.79 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  29.33 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  27.74 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  28.36 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  26.35 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  28.39 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0307  30S ribosomal protein S7  28.78 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000218135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  29.32 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  29.32 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  27.01 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  28.47 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  28.89 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  28.57 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0261  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  29.1 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  28.15 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  28.79 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  28.47 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  25.36 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  28.57 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  28.57 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  27.74 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  28.89 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  26.81 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>