More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0040 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  78.65 
 
 		 193 aa  322  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  67.2 
 
 		 200 aa  265  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  61.86 
 
 		 223 aa  245  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  61.86 
 
 		 224 aa  244  4e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  61.34 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  62.3 
 
 		 224 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  52.58 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  56.68 
 
 		 187 aa  204  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  51.06 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  51.06 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  50.53 
 
 		 188 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  51.6 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  51.35 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  50.81 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  47.83 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  48.97 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  50.54 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  48.37 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  52.15 
 
 		 215 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  47.83 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  49.74 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  51.34 
 
 		 228 aa  177  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  49.21 
 
 		 225 aa  177  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  45.88 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  48.09 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  47.54 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  43.46 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  45.6 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  33.8 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  39.13 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  40.15 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  39.23 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  36.09 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  33.79 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  36.88 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  35.17 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  33.79 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  36.88 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0307  30S ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000218135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  36.17 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  37.82 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>