257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78426 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  81.22 
 
 		 215 aa  341  7e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  76.32 
 
 		 194 aa  308  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  72.36 
 
 		 205 aa  300  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  71.43 
 
 		 225 aa  292  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  51.27 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  51.08 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  51.34 
 
 		 200 aa  188  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  49.24 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  51.63 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  51.87 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  50.53 
 
 		 188 aa  178  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  51.34 
 
 		 194 aa  177  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  49.47 
 
 		 188 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  49.47 
 
 		 188 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  45.7 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  44.09 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  46.28 
 
 		 188 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  45.74 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  43.24 
 
 		 186 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  43.55 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  46.2 
 
 		 187 aa  158  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  43.24 
 
 		 202 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  41.15 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  40.1 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  41.08 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  41.62 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  41.62 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  43.23 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  35.97 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  34.68 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  35 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  31.91 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  33.06 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  29.58 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  35.51 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  31.94 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  30.22 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2068  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 155 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000773315  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  30.22 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  30.5 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>