More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1172 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  78.8 
 
 
185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  65.76 
 
 
185 aa  258  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  60.11 
 
 
197 aa  237  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  58.47 
 
 
204 aa  230  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  57.92 
 
 
204 aa  223  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  54.89 
 
 
204 aa  220  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  54.05 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  55.19 
 
 
194 aa  216  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  56.76 
 
 
217 aa  214  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  53.26 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  52.43 
 
 
188 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  57.38 
 
 
194 aa  210  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  52.17 
 
 
202 aa  209  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  52.43 
 
 
188 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  51.35 
 
 
188 aa  208  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  51.35 
 
 
187 aa  204  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  50.81 
 
 
188 aa  203  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  51.09 
 
 
202 aa  201  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  50.54 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
200 aa  195  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  47.54 
 
 
234 aa  192  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  47.83 
 
 
194 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  47.54 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  45.9 
 
 
223 aa  187  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 
223 aa  184  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 
224 aa  184  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  46.49 
 
 
205 aa  176  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.39 
 
 
194 aa  169  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  42.7 
 
 
215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  43.24 
 
 
228 aa  161  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  38.5 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  43.46 
 
 
199 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  34.07 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  34.31 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  37.23 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  37.93 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  32.84 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  34.07 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  33.83 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  34.07 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  33.33 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  31.33 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  35.65 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  35.65 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 
157 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  30.77 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  34.81 
 
 
155 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  32.59 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  31.85 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  35.34 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  34.07 
 
 
155 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  33.91 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2068  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 
155 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000773315  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  30.5 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  30.5 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  31.06 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  33.58 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  35.29 
 
 
155 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  28.67 
 
 
156 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  32.59 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  33.61 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  28.66 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  31.21 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
158 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  33.9 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>