More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3029 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
157 aa  319  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  83.44 
 
 
157 aa  273  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  83.44 
 
 
157 aa  273  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
157 aa  222  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  65.81 
 
 
157 aa  216  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  60.53 
 
 
155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  63.16 
 
 
155 aa  197  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  63.16 
 
 
155 aa  197  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_414  ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  191  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0448  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  191  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0471  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  191  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000140142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  190  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  190  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  190  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  190  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  190  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  190  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  188  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  188  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  59.74 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  186  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  186  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  186  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 
157 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  185  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  184  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  184  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  184  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  184  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  55.26 
 
 
155 aa  184  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  183  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  183  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  183  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  183  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  183  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0261  30S ribosomal protein S7  58.23 
 
 
160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  181  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  55.92 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  55.19 
 
 
156 aa  179  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>