More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0261 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0261  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  67.5 
 
 
157 aa  208  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  63.75 
 
 
159 aa  207  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  61.88 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  64.38 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  61.25 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  63.12 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  61.25 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  58.75 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  194  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  60.62 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  60.62 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  58.23 
 
 
155 aa  193  8.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  192  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  193  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  192  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  191  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  190  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  190  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  190  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  190  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  190  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  190  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  189  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.62 
 
 
156 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
155 aa  188  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  188  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  56.25 
 
 
156 aa  188  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  59.38 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  56.17 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  57.14 
 
 
157 aa  186  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  58.75 
 
 
156 aa  186  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  56.25 
 
 
156 aa  186  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  56.96 
 
 
155 aa  185  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  185  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  185  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  185  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  54.37 
 
 
156 aa  185  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  54.37 
 
 
156 aa  185  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  54.37 
 
 
156 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  54.37 
 
 
156 aa  185  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  57.5 
 
 
156 aa  184  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  184  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  55.62 
 
 
156 aa  184  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  56.25 
 
 
156 aa  184  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  184  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  184  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  184  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  55.62 
 
 
155 aa  184  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  53.09 
 
 
158 aa  184  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  56.25 
 
 
156 aa  184  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  56.25 
 
 
156 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  184  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  55 
 
 
156 aa  184  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  58.13 
 
 
156 aa  183  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  183  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  56.25 
 
 
156 aa  183  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  55 
 
 
155 aa  183  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  183  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  183  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  56.88 
 
 
156 aa  183  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  52.5 
 
 
156 aa  183  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  183  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  53.75 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  57.5 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.62 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>