More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3687 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  78.8 
 
 		 186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  66.49 
 
 		 185 aa  260  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  63.93 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  59.78 
 
 		 202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  57.61 
 
 		 202 aa  228  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  57.92 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  57.92 
 
 		 187 aa  221  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 		 188 aa  221  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  55.43 
 
 		 202 aa  220  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  57.92 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  54.89 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  57.3 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  53.76 
 
 		 188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  53.23 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  56.28 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  59.02 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  52.15 
 
 		 188 aa  214  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  52.97 
 
 		 193 aa  204  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  53.51 
 
 		 200 aa  204  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 234 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  49.18 
 
 		 224 aa  195  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  50.81 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  48.63 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 223 aa  190  9e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  47.31 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.68 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  43.55 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  44.09 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  40.96 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  39.9 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  34.31 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  33.91 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  33.91 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  29.75 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  30.07 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  33.04 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  31.78 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  32.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0015  30S ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  31.78 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  31.78 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  30 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  30.23 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  31.15 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  29.92 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  28.89 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  28.99 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  33.04 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  28.89 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  30.87 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  28.89 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  30.87 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  29.46 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  29.51 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  30.3 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  30.87 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  29.46 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  33.07 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  28.68 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  27.27 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16331  30S ribosomal protein S7  28.67 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  27.27 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  28.47 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>