More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0307 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0307  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
157 aa  318  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000218135  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 
155 aa  177  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  59.44 
 
 
156 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 
156 aa  175  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  60.14 
 
 
156 aa  174  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  48.41 
 
 
156 aa  174  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  58.04 
 
 
156 aa  174  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 
155 aa  174  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 
155 aa  174  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  174  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  174  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 
156 aa  173  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  173  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  50.96 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3924  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 
155 aa  170  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 
155 aa  170  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  55.24 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  53.15 
 
 
156 aa  169  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 
155 aa  168  2e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  52.45 
 
 
156 aa  168  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 
155 aa  169  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  168  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  168  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  53.8 
 
 
157 aa  168  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  168  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
156 aa  167  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  54.55 
 
 
156 aa  167  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  167  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  167  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  166  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  166  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  166  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  166  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  166  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  166  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  166  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
155 aa  165  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
156 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  48.41 
 
 
156 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  48.41 
 
 
156 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  52.78 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  56.94 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  52.45 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  50.32 
 
 
156 aa  164  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  164  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0722  30S ribosomal protein S7  49.04 
 
 
157 aa  164  5e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0592773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  164  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  53.15 
 
 
156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  52.45 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  163  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  51.75 
 
 
156 aa  163  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  47.77 
 
 
156 aa  163  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  51.05 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  49.04 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  47.77 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 
156 aa  161  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>