100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3254 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
265 aa  540  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  63.67 
 
 
272 aa  341  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  64.06 
 
 
272 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  58.53 
 
 
267 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  59.23 
 
 
272 aa  321  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  59.3 
 
 
269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  59.92 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  58.19 
 
 
243 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
274 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  49.43 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  46.39 
 
 
276 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  50.41 
 
 
250 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  49.38 
 
 
257 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  50.21 
 
 
254 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  48.97 
 
 
257 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  50.21 
 
 
249 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  48.54 
 
 
257 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  49.58 
 
 
250 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  46.22 
 
 
245 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  48.77 
 
 
245 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  47.37 
 
 
245 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  46.96 
 
 
245 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  41.74 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  41.1 
 
 
267 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  44.69 
 
 
236 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 
261 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  40.34 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  41.41 
 
 
265 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  40.53 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.18 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  39.09 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  40 
 
 
267 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  36.44 
 
 
265 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  36.44 
 
 
265 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  39.39 
 
 
249 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  41.52 
 
 
265 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  41.67 
 
 
243 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  39.04 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  38.5 
 
 
256 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  39.91 
 
 
266 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  40.09 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  37.71 
 
 
271 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  38.84 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  38.12 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  38.05 
 
 
256 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  37.7 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  36.67 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  38.71 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  36.13 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  36.61 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  37.33 
 
 
254 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  37.33 
 
 
254 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.93 
 
 
239 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  35.34 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  34.89 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  35.27 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  32.91 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  30.67 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  29.6 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  27.85 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  25.46 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  27.12 
 
 
238 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  30.61 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  31.41 
 
 
263 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  30.94 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  27.11 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  25.61 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  28.76 
 
 
296 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  25.46 
 
 
265 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  28.76 
 
 
296 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  25.46 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  30.72 
 
 
266 aa  45.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  30.72 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  26.69 
 
 
344 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  27.14 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  27.74 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.42 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  25.21 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  30.32 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  27 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  30.34 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  26.29 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  26.38 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  26.38 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  26.38 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  26.38 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  26.38 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  30.82 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  23.69 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  30.15 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  26.09 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>