66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2323 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
254 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  84.52 
 
 
279 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  58.3 
 
 
246 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  53.39 
 
 
256 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  52.54 
 
 
256 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  47.98 
 
 
257 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  49.17 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  48.91 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  49.13 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  45.15 
 
 
265 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  45.15 
 
 
265 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  42.26 
 
 
267 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  41.34 
 
 
290 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  44.26 
 
 
264 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  41.84 
 
 
272 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  42.17 
 
 
265 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  40.74 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  41.59 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  44.02 
 
 
237 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  42.31 
 
 
250 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
261 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  39.32 
 
 
249 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  42.79 
 
 
222 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  40.54 
 
 
239 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
271 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  40.34 
 
 
265 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  40.68 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  38.56 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  38.4 
 
 
271 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  39.56 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  36.33 
 
 
271 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 
276 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  40.18 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  40.18 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  39.57 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  38.17 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  40.26 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  40.79 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  42.04 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  39.84 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  40.79 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  37.89 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  37.95 
 
 
257 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 
264 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  38.17 
 
 
249 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  35.11 
 
 
269 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  36.61 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  33.92 
 
 
267 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  34.62 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  35.58 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  35.68 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  36.55 
 
 
245 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  37.24 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  32.3 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  37.24 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  24.79 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  24.79 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  30.13 
 
 
235 aa  79  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  30.37 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  31.88 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  29.81 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>