67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1188 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  64.73 
 
 		 240 aa  305  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  61.57 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  44.96 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  44.35 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  42.61 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  43.81 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  41.7 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  43.89 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  41.67 
 
 		 272 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  39.09 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  44.44 
 
 		 265 aa  151  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  42.13 
 
 		 272 aa  151  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  41.67 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  42.24 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  43.04 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  41.59 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  40.26 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  41.89 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  41.23 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  40.71 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  39.75 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  42.42 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  41.2 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  40.87 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  41.85 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  41.13 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  42.06 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  37.99 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  37.99 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  40.74 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  38.6 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  38.05 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  40.17 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  38.79 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  39.32 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  39.55 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  37.44 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  36.24 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  37.17 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  35.54 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  36.09 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.38 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  34.98 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  33.89 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  35.34 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  33.18 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  31.42 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  33.48 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  30.43 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  32.3 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  32.3 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  31.06 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  34.33 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  26.94 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  26.94 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  29.36 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  28.43 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  27.49 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  29.73 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3287  glutamine synthetase catalytic region  34.41 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>