72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6310 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  91.44 
 
 		 222 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  64.85 
 
 		 239 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  49.58 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  45.73 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  46.91 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  44.44 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  46.46 
 
 		 290 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  46.46 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  44.16 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  44.16 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  44.4 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  42.11 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  43.81 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  43.91 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  43.04 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  42.11 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  44.44 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  42.04 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  44.23 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.59 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  41.7 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  42.31 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  42.49 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  41.26 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  39.22 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  41.81 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  40.6 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  40.34 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  38.89 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  37.77 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  36.32 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  35.9 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  36.13 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  35.91 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  35.91 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  33.78 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  35 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  34.4 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  34.09 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  35.11 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  34.47 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  34.67 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  31.67 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  38.01 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  35.11 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  35.91 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  35.65 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  34.98 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  35.04 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  34.63 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  32.77 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  32.13 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  31.49 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  34.65 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  30.82 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  30.19 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  34.25 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  33.55 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  27.56 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  31.71 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  31.71 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  32.61 
 
 		 266 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  27.11 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  35.11 
 
 		 273 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>