73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3700 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  56.88 
 
 		 276 aa  327  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  54.09 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  55.97 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  55.56 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  50.97 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  50.19 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  52.92 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  48.84 
 
 		 272 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  50.97 
 
 		 272 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  48.85 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  55.42 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  51.97 
 
 		 254 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  53.31 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  48.51 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  52.23 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  51.57 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  47.68 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  44.96 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  46.52 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  46.96 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  46.96 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  42.56 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  38.3 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  40.27 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  40.16 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  41.48 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  38.96 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  38.4 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  37.92 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  37.92 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  40.89 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  37.83 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  37.25 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  41.56 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.72 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  39.56 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  39.56 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  37.33 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  36.86 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  39.62 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  37.44 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  34.21 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  36.99 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  37.44 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  38.05 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  38.26 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  34.32 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  36.68 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  34.45 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  36.67 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  34.63 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.78 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  34.09 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  33.18 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  33.64 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  31.67 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  27.03 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  30.19 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  26.58 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  25.2 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  26.61 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  26.98 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  27.1 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  27.81 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>