136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5471 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  79.04 
 
 		 297 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  79.31 
 
 		 297 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  57.14 
 
 		 292 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  59.71 
 
 		 289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  48.11 
 
 		 281 aa  234  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  43 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  48.48 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  44.19 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  46.45 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  48.51 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  48.51 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  48.15 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  42.96 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  41.58 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  41.91 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  41.91 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  41.91 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  41.54 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  41.54 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  41.54 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  40.36 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  36.4 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  39.64 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  40.29 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  39.64 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  40.15 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  36.92 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  39.78 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  39.07 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  37.68 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  36.62 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  38.81 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  36.84 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  38.25 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  37.05 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  35.02 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  35.36 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  37.2 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  36.48 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  36.33 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  37.2 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  36.79 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  33.92 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  34.89 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  34.96 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  36.29 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  35.98 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  36.19 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  34.46 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  34.21 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  36.56 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  34.21 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  34.75 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  32.97 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  32.53 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.37 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  26.76 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  30.36 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  30.47 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  30.11 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  31.05 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  29.15 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  28.92 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.55 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.25 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  29.04 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  29.1 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  26.39 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  29.63 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  26.72 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  30.12 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  30.1 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  29.45 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  28.34 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  26.32 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  28.34 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  28.28 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  26.64 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  28.05 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  27.11 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  28.1 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>