136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0856 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  97.98 
 
 
297 aa  591  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  79.04 
 
 
301 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  57.63 
 
 
292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  60.07 
 
 
289 aa  332  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  44.91 
 
 
290 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  43.82 
 
 
296 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  46.97 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  50.37 
 
 
290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 
295 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  45.04 
 
 
310 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  46.59 
 
 
281 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  42.7 
 
 
284 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  41.28 
 
 
299 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 
312 aa  201  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  47.15 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  41.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  41.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  41.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  41.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  41.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  41.22 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
298 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
298 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
298 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  42.45 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  41.3 
 
 
310 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  36.69 
 
 
285 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  40.36 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  35.88 
 
 
312 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  37.63 
 
 
321 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  38.77 
 
 
295 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  37.82 
 
 
298 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  40.5 
 
 
296 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  39.13 
 
 
293 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  37.63 
 
 
293 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  39.22 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  37.97 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  36.92 
 
 
293 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 
294 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  34.66 
 
 
295 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  37.5 
 
 
314 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  33.22 
 
 
295 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  36.11 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 
295 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  35.4 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  36.09 
 
 
296 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  34.02 
 
 
295 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  36.09 
 
 
296 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  35.58 
 
 
295 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  32.88 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  37.05 
 
 
296 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  36.74 
 
 
319 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  34.22 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  33.68 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  31.07 
 
 
286 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  31.07 
 
 
286 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  31.77 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  35.74 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  32.97 
 
 
302 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  30.24 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  31.28 
 
 
270 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  31.68 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  29.07 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  34.96 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  34.01 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  32.38 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  28.88 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  34.43 
 
 
287 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  31.16 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.86 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  31.97 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.3 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
285 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  31.3 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  31.3 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  31.3 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  29.48 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.42 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  31.46 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  31.15 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  29.08 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  30.61 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  29.92 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.49 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  30.14 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  31.02 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  29.51 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  30.49 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.49 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  30.11 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  29.39 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  30.23 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>