67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5347 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  49.18 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  49.18 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  44.31 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  46.36 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  45.6 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  45.53 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  45.75 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  45.87 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  47.52 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  44.02 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  43.15 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  44.13 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  43.27 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  44.08 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  41.74 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  41.25 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  44.03 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  42.31 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  41.11 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  41.26 
 
 		 239 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  38.84 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  42.42 
 
 		 237 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  41.11 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  42.34 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  39.6 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  37.96 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  40.25 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  36.48 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  38.33 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  38.15 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  37.66 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  38 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  38.66 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  36.86 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  39.66 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  37.71 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  38.84 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  34.9 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  37.29 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  39.19 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  35.71 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  38.06 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  35.9 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  38.08 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  36.29 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  37.17 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  36.86 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  36.86 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  35.27 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  26.23 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  30.98 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  26.78 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  28.96 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  30.65 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  28.34 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  31.25 
 
 		 266 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>