91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3979 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3979  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 290 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4136  N-formylglutamate amidohydrolase  88.43 
 
 		 249 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1477  N-formylglutamate amidohydrolase  80.46 
 
 		 265 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0966  N-formylglutamate amidohydrolase  72.52 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537929  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6779  hypothetical protein  69.88 
 
 		 267 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2443  N-formylglutamate amidohydrolase  70.16 
 
 		 266 aa  334  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2868  N-formylglutamate amidohydrolase  70.37 
 
 		 282 aa  322  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0544218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1548  N-formylglutamate amidohydrolase  62.03 
 
 		 267 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04581  N-formylglutamate amidohydrolase  56.33 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0695  N-formylglutamate amidohydrolase  55.13 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5770  N-formylglutamate amidohydrolase  51.22 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3383  N-formylglutamate amidohydrolase  52.97 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2568  N-formylglutamate amidohydrolase  51.23 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4492  N-formylglutamate amidohydrolase  47.7 
 
 		 272 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169802  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0731  hypothetical protein  42.39 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0685  hypothetical protein  42.39 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.628694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2634  N-formylglutamate amidohydrolase  46.55 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00609406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2463  N-formylglutamate amidohydrolase  43.57 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5347  N-formylglutamate amidohydrolase  43.15 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.730049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6310  hypothetical protein  46.46 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2056  N-formylglutamate amidohydrolase  44.2 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2132  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.796049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72700  hypothetical protein  46.12 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.659003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2635  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1871  N-formylglutamate amidohydrolase  41.95 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0997  N-formylglutamate amidohydrolase  41.34 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.805817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2323  hypothetical protein  41.34 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2895  N-formylglutamate amidohydrolase  41.13 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2975  N-formylglutamate amidohydrolase  42.98 
 
 		 257 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3877  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0125  N-formylglutamate amidohydrolase  45.37 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.383342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2748  N-formylglutamate amidohydrolase  42.55 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.148602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1606  N-formylglutamate amidohydrolase  39.23 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2032  N-formylglutamate amidohydrolase  40.86 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2870  N-formylglutamate amidohydrolase  41.41 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5202  N-formylglutamate amidohydrolase  42.49 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0675  N-formylglutamate amidohydrolase  40.43 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0446  N-formylglutamate amidohydrolase  40.79 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3254  N-formylglutamate amidohydrolase  41.78 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1690  hypothetical protein  41.3 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2485  N-formylglutamate amidohydrolase  44.68 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3700  N-formylglutamate amidohydrolase  37.83 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0308146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2787  N-formylglutamate amidohydrolase  39 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288575 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4543  N-formylglutamate amidohydrolase  39.65 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1750  hypothetical protein  39.3 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3592  N-formylglutamate amidohydrolase  38.53 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332405  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3232  N-formylglutamate amidohydrolase  37.8 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1163  N-formylglutamate amidohydrolase  37.83 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0413  N-formylglutamate amidohydrolase  43.51 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1767  N-formylglutamate amidohydrolase  43.51 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2678  N-formylglutamate amidohydrolase  37.76 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  40.87 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0227  N-formylglutamate amidohydrolase  37.85 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3692  hypothetical protein  35.78 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3291  N-formylglutamate amidohydrolase  38.46 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5966  N-formylglutamate amidohydrolase  40.34 
 
 		 250 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2277  N-formylglutamate amidohydrolase  43.04 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338989  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1783  N-formylglutamate amidohydrolase  37.29 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3849  N-formylglutamate amidohydrolase  30.9 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0908  N-formylglutamate amidohydrolase  31.84 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.355594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1455  N-formylglutamate amidohydrolase  36.18 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5782  N-formylglutamate amidohydrolase  32.2 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1036  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.691289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0420  hypothetical protein  26.34 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0444  hypothetical protein  25.89 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  32.31 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  37.42 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  36.75 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  33.16 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  34.48 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  33.1 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  32.03 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  27.59 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.67 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  27.11 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  28.77 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.39 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  26.35 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  35.97 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  35.62 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  26.9 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  28.08 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  27.85 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  26.9 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  27.45 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.45 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  27.11 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  27.22 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>