152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1536 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  91.14 
 
 
271 aa  520  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  84.13 
 
 
270 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  70.68 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  70.68 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  70.68 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  70.3 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  70.68 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  69.92 
 
 
344 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  70.68 
 
 
285 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  69.55 
 
 
288 aa  390  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  72.14 
 
 
265 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  72.14 
 
 
265 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  72.14 
 
 
265 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  72.14 
 
 
265 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  70.99 
 
 
265 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  70.99 
 
 
265 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  70.61 
 
 
265 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  59.48 
 
 
270 aa  334  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  58.52 
 
 
271 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  56.23 
 
 
273 aa  321  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  56.6 
 
 
287 aa  310  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  53.7 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  53.61 
 
 
274 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  53.85 
 
 
270 aa  298  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  52.63 
 
 
274 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  53.08 
 
 
270 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  52.06 
 
 
274 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  52.57 
 
 
274 aa  278  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  52.17 
 
 
262 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  52.65 
 
 
291 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  51.52 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  52.09 
 
 
266 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  51.71 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  46.89 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  52.92 
 
 
264 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  51.45 
 
 
267 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  48.64 
 
 
267 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
267 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  51.38 
 
 
269 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  45.42 
 
 
270 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  52.61 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  50.41 
 
 
267 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  50.41 
 
 
267 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  47.15 
 
 
266 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  48.22 
 
 
266 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  46.77 
 
 
266 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.27 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  47.47 
 
 
267 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  46.61 
 
 
266 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  47.04 
 
 
266 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  45.75 
 
 
284 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  47.17 
 
 
267 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  43.66 
 
 
271 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  47.41 
 
 
268 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  47.41 
 
 
268 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  41.33 
 
 
285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  47.41 
 
 
267 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  43.53 
 
 
267 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  45.08 
 
 
271 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  43.8 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  43.41 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  43.8 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  42.37 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  42.69 
 
 
273 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  43.75 
 
 
266 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  46.25 
 
 
263 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  42.59 
 
 
267 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  41.89 
 
 
268 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  39.48 
 
 
271 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  34.51 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  34.82 
 
 
293 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  31.95 
 
 
286 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  31.52 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  30.42 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  32.95 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  30.54 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  30.11 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  30.43 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  29.02 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  31.23 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
298 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  30.54 
 
 
296 aa  95.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  30.54 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  31.69 
 
 
296 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
296 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  31.69 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
314 aa  92  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  30.62 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  30.56 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  31.02 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  32.24 
 
 
297 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  29.89 
 
 
296 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>