139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5824 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
266 aa  543  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  93.98 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  72.56 
 
 
266 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  72.93 
 
 
266 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  73.96 
 
 
266 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  70.3 
 
 
267 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  71.32 
 
 
267 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  70.94 
 
 
267 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  71.7 
 
 
267 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  70.08 
 
 
269 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  61 
 
 
267 aa  343  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  59.46 
 
 
268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  59.46 
 
 
268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  59.07 
 
 
267 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  58.27 
 
 
266 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  56.77 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  55.51 
 
 
266 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  51.18 
 
 
271 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  54.12 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  53.64 
 
 
270 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  51.52 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  52.92 
 
 
270 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  51.92 
 
 
271 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  52.63 
 
 
271 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
285 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  52.34 
 
 
288 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  51.15 
 
 
287 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
267 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
344 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  53.1 
 
 
291 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  52.14 
 
 
265 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  52.33 
 
 
265 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  52.04 
 
 
274 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  52.09 
 
 
271 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  48.3 
 
 
270 aa  254  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  51.36 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  51.36 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  51.75 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  51.75 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  48.66 
 
 
274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 
265 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  48.28 
 
 
274 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  50.58 
 
 
270 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  52.09 
 
 
264 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  51.14 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  50.97 
 
 
270 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  50.19 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  47.27 
 
 
271 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  42.64 
 
 
262 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.99 
 
 
271 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  47.35 
 
 
270 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  44.91 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  45.42 
 
 
266 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  46.22 
 
 
266 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  45.97 
 
 
273 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  45.42 
 
 
266 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  46.37 
 
 
267 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  48.45 
 
 
267 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  50.22 
 
 
277 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  45.11 
 
 
271 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 
268 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  43.41 
 
 
258 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  44.66 
 
 
285 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  45.35 
 
 
267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  40.5 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  32.78 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  34.44 
 
 
314 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  31.8 
 
 
298 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  31.05 
 
 
296 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
298 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 
295 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  36.45 
 
 
287 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  31.54 
 
 
321 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  31.4 
 
 
294 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  29.55 
 
 
293 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  32.38 
 
 
285 aa  99  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  29.72 
 
 
293 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  31.47 
 
 
312 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  32.22 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  31.51 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  29.53 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  32.17 
 
 
312 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  32.52 
 
 
296 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  32.04 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  27.27 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  31.35 
 
 
290 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 
281 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>