137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3345 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
312 aa  634    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  99.36 
 
 
312 aa  631  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  73.25 
 
 
310 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  77.85 
 
 
295 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  77.62 
 
 
290 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  70.97 
 
 
281 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  68.46 
 
 
281 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  56.77 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  55.47 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 
292 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  47.31 
 
 
289 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  48.51 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  47.15 
 
 
297 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  46.77 
 
 
297 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  45.86 
 
 
310 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  41.76 
 
 
293 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  41.13 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  39.93 
 
 
299 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  41.13 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  41.13 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  40.75 
 
 
302 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  40.75 
 
 
302 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  40.75 
 
 
302 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  39.55 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  41.82 
 
 
297 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  40.54 
 
 
321 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  40.25 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  38.95 
 
 
295 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  37.63 
 
 
296 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  37.23 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  39.13 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  38.6 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  37.85 
 
 
298 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  40.31 
 
 
296 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  40.16 
 
 
298 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  39.33 
 
 
298 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  39.33 
 
 
298 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 
340 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  35.48 
 
 
295 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  37.31 
 
 
296 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  36.7 
 
 
296 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  35.79 
 
 
293 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  41.42 
 
 
319 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  37.7 
 
 
295 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  39.46 
 
 
286 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  36.65 
 
 
293 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  39.25 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  36.26 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  35.69 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 
284 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 
295 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  36.3 
 
 
314 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  39.59 
 
 
285 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  38.06 
 
 
286 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  37.65 
 
 
286 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  34.1 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  35.51 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 
286 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  33.21 
 
 
286 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  34.38 
 
 
291 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  32.73 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  32.48 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  33.81 
 
 
264 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  31.58 
 
 
270 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  31.52 
 
 
271 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  31.6 
 
 
266 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 
270 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  32.26 
 
 
267 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  31.29 
 
 
269 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  32.51 
 
 
263 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  31.47 
 
 
266 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  32.36 
 
 
273 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  30.86 
 
 
267 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  31.5 
 
 
267 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  32.62 
 
 
265 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 
285 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 
267 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 
267 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 
267 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 
267 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  31.39 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  30.07 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  29.25 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  29.7 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  30.47 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  31.43 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  31.64 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  31.43 
 
 
265 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 
258 aa  96.3  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  31.16 
 
 
288 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.72 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  31.83 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  30.82 
 
 
266 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  28.37 
 
 
267 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 
271 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>