142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2223 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  98.88 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  67.55 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  62.55 
 
 		 266 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  60.23 
 
 		 266 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  61.83 
 
 		 266 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  60.23 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  61.36 
 
 		 266 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  59.46 
 
 		 266 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  61.78 
 
 		 267 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  59.62 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  58.69 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  60.38 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  57.69 
 
 		 269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  56.76 
 
 		 266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  56.6 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  50.21 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  48.45 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  49.62 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  45.45 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  45.56 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  45.19 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  48.24 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.09 
 
 		 271 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  47.45 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  46.59 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  47.08 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  48.63 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  47.45 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  47.45 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  47.2 
 
 		 288 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  46.27 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  47.08 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  47.6 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  47.6 
 
 		 267 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  47.6 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  48 
 
 		 344 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  47.6 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  47.6 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  47.6 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  46.36 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.64 
 
 		 291 aa  228  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  48.29 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  47.41 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  46.27 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  46.27 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  42.8 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  43.17 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  41.44 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  44.06 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  43.97 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  44.94 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  40.74 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  41.27 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  41.83 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  38.76 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  39.27 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  39.41 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  39.61 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  38.1 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  45.09 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  37.89 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  35 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.03 
 
 		 287 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  30.25 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  27.84 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  27.07 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  29.72 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  28.15 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  28.15 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  25.19 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  26.25 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  26.6 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  26.32 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  25.63 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  26.89 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  26.32 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  26.05 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  27.5 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  25.63 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  26.78 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  26.78 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  26.34 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  27.64 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  26.62 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  26.03 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>