137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1003 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1317  N-formylglutamate amidohydrolase  33.83 
 
 
271 aa  174  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0639  N-formylglutamate amidohydrolase  33.96 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  28.82 
 
 
262 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
271 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.43 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  28.82 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  28.28 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  28.28 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  30.62 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  27.27 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  26.75 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  27.87 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  29.51 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  26.46 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  26.45 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  27.63 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  27.76 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.38 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.95 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  27.68 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  28.57 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  28.98 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  29.39 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  26.75 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.46 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  28.57 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  27.73 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  26.38 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  27.63 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  27.05 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  26.21 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  26.83 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  27.71 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  29.18 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  27.9 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  26.46 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  29.07 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  25.27 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  26.75 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  28.76 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  25.51 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  27.71 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  28.27 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  27.27 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  28.51 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  27.2 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  26.84 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  28.93 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  26.29 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  28.07 
 
 
344 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  27.17 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  27.17 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  26.69 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  25.61 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  26.61 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  26.5 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  27.66 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  27.47 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  28.4 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  25.2 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  26.87 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  26.74 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  22.58 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  28.05 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  27.04 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  27.04 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  22.58 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  22.58 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  26.46 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  26.02 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  26.21 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3287  glutamine synthetase catalytic region  23.55 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  25.78 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  26.46 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  22.58 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  24.69 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  26.92 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  26.41 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  26.46 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  24.69 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  22.22 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  22.22 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>