137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8166 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  39.72 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  37.41 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  40.66 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  37.93 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  37.69 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  36.69 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  40.25 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  36.69 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  35.17 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  35.88 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  37.27 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  39.83 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  39.43 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  37.13 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  34.18 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  32.73 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  34.55 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  34.57 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  32.97 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  33.09 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  33.7 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  32.98 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  34.06 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  32.98 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  32.98 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  32.98 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  32.98 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  32.62 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  31.18 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  34.88 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  33.09 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  32.2 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  32.2 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  34.77 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  34.06 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  31.62 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  30.32 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  35.02 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  32.35 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  34.6 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  31.99 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  29.82 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  31.69 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  29.82 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  31.52 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  32.31 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  29.45 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  33.46 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  31.16 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  35.44 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  31.44 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  30.23 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  26.67 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  30.38 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  27.63 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  30.15 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  29.04 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  32.69 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  28.89 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.42 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.95 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  28.19 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.19 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  24.72 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  27.07 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  26.84 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  27.57 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  27.99 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  27.4 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  28.19 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  28.19 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  28.75 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  29.2 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  26.75 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  28.08 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  25.1 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  26.47 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  28.33 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  27.39 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>