145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2166 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  97.74 
 
 
265 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  95.85 
 
 
265 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  95.47 
 
 
265 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  95.85 
 
 
265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  90.57 
 
 
265 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  78.63 
 
 
267 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  77.86 
 
 
344 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  76.81 
 
 
288 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  78.63 
 
 
285 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  78.63 
 
 
267 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  78.63 
 
 
267 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  77.86 
 
 
267 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  78.63 
 
 
267 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  71.76 
 
 
270 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  70.61 
 
 
271 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  70.99 
 
 
271 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  59.7 
 
 
271 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  59.39 
 
 
270 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  58.08 
 
 
287 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  55.34 
 
 
273 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  55.29 
 
 
274 aa  298  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  56.11 
 
 
271 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  55.29 
 
 
274 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  55.47 
 
 
274 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  53.82 
 
 
270 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  52.11 
 
 
291 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  54.34 
 
 
274 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  51.74 
 
 
270 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 
266 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  53.28 
 
 
266 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  52.1 
 
 
267 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  51.75 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  50.58 
 
 
266 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  48.22 
 
 
262 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  49.03 
 
 
267 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 
269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  48.05 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  48.05 
 
 
266 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  49.16 
 
 
267 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  47.66 
 
 
266 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  50.41 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  47.45 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  47.45 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  46.07 
 
 
277 aa  228  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  42.97 
 
 
270 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  47.06 
 
 
267 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  43.6 
 
 
266 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  42.75 
 
 
266 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  45.88 
 
 
267 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  43.2 
 
 
266 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  45.08 
 
 
271 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  46.01 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  44.71 
 
 
266 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  43.6 
 
 
273 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  45.78 
 
 
263 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 
266 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  44.36 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  45.69 
 
 
271 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  44.98 
 
 
284 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  48.5 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  43.5 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  42.62 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  45.34 
 
 
285 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 
271 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 
268 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  45.37 
 
 
267 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  32.71 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  31.92 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
298 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  31.13 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 
310 aa  95.5  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  30.13 
 
 
293 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  31.07 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  29.22 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 
293 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  30.48 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  29.97 
 
 
290 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 
289 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  31.07 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  31.28 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  28.86 
 
 
314 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 
312 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  27.67 
 
 
295 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  30.12 
 
 
321 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  30.65 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  29.1 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  28.4 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  28.4 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  27.89 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  28.19 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>