150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2205 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  99.62 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  95.47 
 
 		 265 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  95.47 
 
 		 265 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  94.72 
 
 		 265 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  95.09 
 
 		 265 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  90.94 
 
 		 265 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  79.01 
 
 		 267 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  78.24 
 
 		 344 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  79.01 
 
 		 285 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  79.01 
 
 		 267 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  79.01 
 
 		 267 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  78.24 
 
 		 267 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  79.01 
 
 		 267 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  77.19 
 
 		 288 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  72.14 
 
 		 271 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  70.99 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  71.37 
 
 		 270 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  60.08 
 
 		 271 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  59.54 
 
 		 270 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  57.92 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  55.34 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  56.11 
 
 		 271 aa  297  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  54.9 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  54.9 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  53.05 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  54.34 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  54.58 
 
 		 274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  52.49 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  52.14 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  51.35 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  52.32 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  52.9 
 
 		 266 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  48.44 
 
 		 267 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  52.53 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  51.36 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  50.78 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  50.58 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  48.22 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  51.64 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  49.58 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  48.44 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  48.74 
 
 		 267 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  48.05 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  44.14 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  47.76 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  46.67 
 
 		 267 aa  229  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  43.14 
 
 		 266 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  44 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  46.67 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  46.27 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  46.27 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  43.6 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  45.45 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  45.63 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  44 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  43.31 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  46.07 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  43.2 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  45.6 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  43.5 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  48.5 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  45.78 
 
 		 284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  41.96 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  44.92 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  42.21 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  40.16 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  39.15 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  45.22 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  31.82 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  30.86 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  32.02 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  30.63 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  31.01 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  31.07 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  31.43 
 
 		 312 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  31.43 
 
 		 312 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  30.98 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  28.06 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  28.75 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 		 321 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  29.68 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  27.5 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  27.82 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  28.4 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  28.4 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  30.65 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  27.57 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  27 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>