153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0156 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  76.78 
 
 
271 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  73.86 
 
 
274 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  71.54 
 
 
273 aa  400  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  73.8 
 
 
274 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  73.31 
 
 
274 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  66.54 
 
 
270 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  64.39 
 
 
271 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  57.35 
 
 
288 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  57.91 
 
 
285 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  59.85 
 
 
267 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  59.85 
 
 
267 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  59.85 
 
 
267 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  59.85 
 
 
267 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  57.91 
 
 
344 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  59.47 
 
 
267 aa  321  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  57.36 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  56.6 
 
 
271 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  56.65 
 
 
271 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  58.3 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  57.92 
 
 
265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  58.08 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  57.47 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  58.08 
 
 
265 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  58.08 
 
 
265 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  57.69 
 
 
265 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  57.59 
 
 
270 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  55.64 
 
 
270 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  54.05 
 
 
267 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  53.58 
 
 
274 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  54.33 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  53.12 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  51.97 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
267 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  50.19 
 
 
266 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 
266 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  51.15 
 
 
266 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  51.57 
 
 
266 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  53.47 
 
 
267 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  54.58 
 
 
264 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  54.05 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  51.84 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  46.69 
 
 
270 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  51.43 
 
 
267 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  49.25 
 
 
270 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  51.55 
 
 
267 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  46.9 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  46.95 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44.66 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  46.95 
 
 
266 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  46.88 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  48.45 
 
 
268 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  48.45 
 
 
268 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  43.53 
 
 
277 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  48.06 
 
 
267 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  44.88 
 
 
267 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  45.7 
 
 
268 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  45.31 
 
 
271 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 
266 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  44.4 
 
 
266 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  44 
 
 
266 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  46.64 
 
 
267 aa  228  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  42.48 
 
 
285 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  44.71 
 
 
263 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  45.11 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  43.66 
 
 
271 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  42.76 
 
 
284 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  41.73 
 
 
258 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  42.37 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  43.66 
 
 
267 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  35.27 
 
 
293 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 
293 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  30.94 
 
 
293 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  30.66 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  32.14 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  32.54 
 
 
296 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 
296 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  29.22 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  27.38 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  31.5 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  31.51 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  29.73 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 
293 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  29.76 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  30.86 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  31.08 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 
295 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  34.43 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  28.11 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  29.37 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  28.11 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  34.43 
 
 
297 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  27.38 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  27.51 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  29.32 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>