139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4657 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  76.6 
 
 		 267 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  77.1 
 
 		 273 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  74.44 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  73.58 
 
 		 266 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  72.83 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  72.08 
 
 		 266 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  71.05 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  69.43 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  63.1 
 
 		 258 aa  331  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  51.17 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  49.08 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  48.69 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  47.45 
 
 		 270 aa  244  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  47.76 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  52.99 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  45.31 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  49.81 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  46.48 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  45.49 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  47.27 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  46.09 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  46.62 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  42.37 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  45.38 
 
 		 274 aa  224  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  44.09 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  45.62 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  43.13 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  45.08 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  43.7 
 
 		 344 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  43.51 
 
 		 288 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  44.44 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  43.08 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  46.84 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  50.87 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  44.19 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  43.53 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  45.67 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  44.88 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  44.88 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  45.98 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  41.96 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  50.22 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  41.96 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  41.41 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  43.92 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  46.81 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  41.41 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  46.32 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  44.05 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  37.93 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  43.08 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  44.66 
 
 		 291 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  42.46 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  39.84 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 267 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  38.89 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  32.26 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  32.2 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  32.2 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  30.28 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  31.44 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  32.49 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  31 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  32.5 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  30.93 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  31.06 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  31.36 
 
 		 295 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  29.44 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  29.3 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  29.44 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  31.85 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  31.78 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  31.36 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  31.87 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  31.95 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  30.68 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  30.97 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  32.17 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  28.37 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  28.16 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>