137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2718 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  68.26 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  67.92 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  68.84 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  64.44 
 
 		 296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  64.44 
 
 		 296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  62.68 
 
 		 296 aa  351  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  59.86 
 
 		 296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  62.83 
 
 		 296 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  58.36 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  61.71 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  61.71 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  60.97 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  56.89 
 
 		 295 aa  321  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  58.24 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  61.34 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  57.35 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  56.13 
 
 		 295 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  56.13 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  55.76 
 
 		 295 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  55.39 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  55.02 
 
 		 295 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  53.16 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  53.24 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  56 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  52.43 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  51.65 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  47.43 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  44.6 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  44.44 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  41.69 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  41.36 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  42.6 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  44.29 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  41.44 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  40.65 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  40.55 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.11 
 
 		 286 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  40.45 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  39.26 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  39.1 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.09 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  40.6 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  38.35 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  39.85 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  39.13 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  36.67 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  38.71 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  36.92 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  34.66 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  35.87 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.87 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  31.18 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  35.87 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  35.87 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  35.87 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  35.87 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  35.19 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  36.79 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  36.59 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  32.26 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  30.51 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  29.56 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  31.93 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  29.92 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  29.93 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  30.36 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  28.69 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  27.87 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  29.24 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  29.55 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  30.54 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  30.54 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  28.95 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  28.87 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  30.33 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  28.83 
 
 		 266 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  29.53 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  30.42 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  27.78 
 
 		 263 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  28.29 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  27.35 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  28.94 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  29.55 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  28.34 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  28.97 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>