139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1334 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  44.8 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  38.68 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  37.86 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  35.59 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  35.38 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  34.82 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  36.59 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  36.47 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  36.47 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  35.02 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  38.59 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  37.85 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  33.22 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  34.27 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  33.22 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  35.41 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  32.58 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  36.17 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  34.32 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  32.2 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  34.29 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  33.87 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  32.63 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  33.77 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  30.98 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  35.08 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  34.14 
 
 		 296 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  37.1 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  33.21 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  31.76 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  34.39 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  32.85 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  32.85 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  31.46 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  34.38 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  33.98 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  29.46 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  32.4 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  32.33 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  34.39 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  32.53 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  31.68 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  31.68 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  32.08 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  29.8 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  32.81 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  32.37 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  32.37 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  32.17 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  30.92 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  32.02 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  32.56 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  30.93 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  30.64 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  30.54 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  31.73 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  33.74 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  28.35 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  31.23 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.92 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.96 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  29.17 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.08 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  28.87 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  29.59 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  31.2 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  28.69 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  31.97 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  32.77 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  30.49 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  29.24 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.71 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  24.89 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  29.36 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  30.17 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  32.25 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>