141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0056 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  50.75 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  50.37 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  48.89 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  50.36 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  50.93 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  49.44 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  47.12 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  44.56 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  44.56 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  41.61 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  43.96 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  44.71 
 
 		 295 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  41.32 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  44.36 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  43.78 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  41.76 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  41.54 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  41.28 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  40.65 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  42.09 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  41.55 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  40.44 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  38.57 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  40.07 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  39.71 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  38.77 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  41.09 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  39.77 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  40.88 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  38.04 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  43.24 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  41.8 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  37.68 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.61 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.09 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  34.31 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  35.36 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  35.36 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  34.19 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  33.96 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  37.86 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  34.6 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  33.81 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  33.83 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  34.22 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  32.84 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  33.09 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  31.44 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  34.98 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  35.51 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  35.51 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  33.09 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  33.06 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  33.06 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  33.06 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  33.06 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  32.05 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  31.85 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  36.45 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  36.41 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  34.98 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  34.19 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  29.91 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  38.31 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  34.98 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  33.99 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  32.78 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  33.5 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  35.51 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  33.03 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  33.03 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  31.48 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  31.17 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  33.61 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  31.89 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  33.19 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  31.75 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  32.94 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  28.51 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  31.65 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  33.19 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  32.63 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.61 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  34.13 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  33.08 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.91 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  33.08 
 
 		 344 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  31.91 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  31.91 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  31.91 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>