136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0136 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  39.65 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  40.56 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  37.11 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  39.64 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  38.6 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  34.17 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  35.64 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  35.29 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  37.96 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  36.84 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  38.87 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  36.3 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  36.81 
 
 		 298 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  36.81 
 
 		 298 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  36.03 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  34.63 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  35.22 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  38.04 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  44.8 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  32.96 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  35.85 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  35.44 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  36.5 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  36.63 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  37.09 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  33.57 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  36.29 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  36.29 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  37.82 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  37.59 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.08 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  34.48 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  40.49 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  35.57 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  34.63 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  35.39 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  29.54 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  31.16 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  35.27 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  34.02 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 		 281 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  33.21 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  32.85 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  34.06 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  33.73 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  35.74 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  30.59 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  28.51 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  28.16 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  35.83 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  31.62 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  32.35 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  32.63 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  31.67 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  32.7 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  34.15 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  31.4 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  30.97 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  29.83 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  29.83 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  29.83 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  29.44 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  30.12 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  31.76 
 
 		 263 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  31.76 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  29.79 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  31.22 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  32.24 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  29.24 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  29.84 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  31.22 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  30.21 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  28.05 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  29.06 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  29.76 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  31.4 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  30.16 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.16 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  30.56 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  30.34 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>