150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0159 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  60.98 
 
 		 270 aa  331  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  57.2 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  55.97 
 
 		 271 aa  301  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  57.59 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  56.08 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  54.2 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  54.02 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  53.44 
 
 		 265 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  53.85 
 
 		 271 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  53.44 
 
 		 265 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  53.82 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  53.82 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  53.05 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  55.6 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  53.08 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  56.08 
 
 		 266 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  56.08 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  53.05 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  52.83 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  53.05 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  52.83 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  52.45 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  52.45 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  52.45 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  52.45 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  52.45 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  53.46 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  52.08 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  56.59 
 
 		 291 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  54.69 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  57.52 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  50.95 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  52.49 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  53.39 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  51.16 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  49.61 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  49.24 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  53.5 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  51.59 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  46.9 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  51.01 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  51.42 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 		 266 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  47.58 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  48.09 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  51.56 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  50.97 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  49.21 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  45.15 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  49.02 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  50.98 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  48.81 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  48.63 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  48.63 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  45.67 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  47.31 
 
 		 266 aa  231  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  45.45 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  46.25 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  44.62 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  45.31 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  47.27 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44.66 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  44.92 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  44.36 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  44.49 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  40.62 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  34.73 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  30.58 
 
 		 298 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  32.3 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  30.45 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  31.17 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  28.81 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  29.34 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  29.34 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  30.49 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  30.56 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  27.97 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  28.99 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  30.89 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  29.66 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  31.58 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  29.71 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>