138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2656 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
266 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  75.47 
 
 
266 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  65.37 
 
 
267 aa  352  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  61.36 
 
 
268 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  61.36 
 
 
268 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  60.98 
 
 
267 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  57.79 
 
 
266 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  55.51 
 
 
266 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  54.75 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  57.79 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  58.43 
 
 
267 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  55.47 
 
 
269 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  56.97 
 
 
266 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  56.49 
 
 
267 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  54.92 
 
 
267 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  55.51 
 
 
267 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  57.38 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  54.15 
 
 
271 aa  262  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  50.19 
 
 
287 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  51.53 
 
 
270 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  50.4 
 
 
273 aa  254  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  49.41 
 
 
270 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  49 
 
 
274 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  49.8 
 
 
274 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  53.33 
 
 
264 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  47.53 
 
 
271 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  47.69 
 
 
274 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  48.09 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  47.83 
 
 
271 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  45.77 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  47.71 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  46.36 
 
 
271 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 
291 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  47.04 
 
 
271 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  46.03 
 
 
267 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 
267 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  45.63 
 
 
344 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  45.45 
 
 
288 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 
267 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 
267 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 
267 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  45.24 
 
 
285 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  46.07 
 
 
270 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  45.06 
 
 
265 aa  224  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  45.14 
 
 
265 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 
265 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  44.27 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  44.36 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  44.36 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  43.58 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  41.06 
 
 
262 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  43.92 
 
 
271 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44.35 
 
 
273 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  45.1 
 
 
263 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  42.51 
 
 
267 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  39.92 
 
 
266 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  43.32 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  43.02 
 
 
270 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  41.02 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  40.55 
 
 
268 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  39.16 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  42.35 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  38.78 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  41.31 
 
 
267 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  41.63 
 
 
277 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  42.06 
 
 
285 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  40.55 
 
 
271 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  39.29 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  36.46 
 
 
284 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  28.99 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  28.52 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  28.99 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  26.89 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 
296 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  26.98 
 
 
321 aa  82  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  26.43 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  24.36 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7802  N-formylglutamate amidohydrolase  29.39 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  26.58 
 
 
314 aa  79  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  28.79 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  25.19 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  27.31 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  26.24 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  26.92 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  25.74 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  27.66 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  26.62 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  29.07 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  26.62 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  26.56 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  24.37 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  26.44 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  27.2 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  27.2 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  27.24 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>