138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2540 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  78.65 
 
 		 281 aa  447  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  70.61 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  70.97 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  71.12 
 
 		 290 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  66.07 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  67.99 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  53.38 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  51.65 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  48.11 
 
 		 301 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  46.97 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  46.72 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  46.21 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  46.12 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  41.35 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  40.38 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  42.31 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  38.7 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  38.7 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  38.7 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.07 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  40.7 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  37.69 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  40.6 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  37.27 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  39.11 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  40.39 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  39.69 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  36.4 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.17 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  37.22 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  38.17 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  38.78 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  37.04 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  38.87 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  39.26 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  38.24 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  37.64 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  37.8 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  36.54 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  37.02 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  36.23 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  37.92 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  35.47 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  35.38 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  34.67 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  34.08 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  32.84 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  35.39 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  34.34 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  30.86 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  30.85 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  30.98 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  30.96 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  30.5 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  32.4 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  31.41 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  31.43 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  29.54 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  27.21 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  31.35 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.93 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.04 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.11 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  30.31 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  28.85 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  27.45 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  31.31 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  28.94 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  30.52 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  31.14 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  30.37 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  29.67 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  27.06 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.64 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  29.09 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  27.96 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  28.83 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>