137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3473 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  92.95 
 
 
298 aa  564  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  92.28 
 
 
298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  72.67 
 
 
300 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  72.6 
 
 
296 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  71.58 
 
 
296 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  59.06 
 
 
321 aa  346  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  59.01 
 
 
295 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  58.62 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  57.04 
 
 
295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  59.45 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  55.3 
 
 
295 aa  335  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  58.97 
 
 
295 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  56.6 
 
 
295 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  59.56 
 
 
296 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  59.56 
 
 
296 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  54.79 
 
 
295 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  58.46 
 
 
296 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  61.34 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  57.99 
 
 
293 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  58.74 
 
 
298 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  56.93 
 
 
293 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  54.55 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  56.93 
 
 
296 aa  311  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  54.7 
 
 
340 aa  301  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  52.81 
 
 
310 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 
297 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  47.5 
 
 
293 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  47.62 
 
 
319 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  43.4 
 
 
286 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  45.25 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  41.26 
 
 
287 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  40 
 
 
286 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  40 
 
 
286 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  42.12 
 
 
285 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  39.71 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  40.51 
 
 
286 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 
297 aa  191  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  42.5 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  39.86 
 
 
292 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 
281 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  37.81 
 
 
296 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  38.57 
 
 
310 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  37.63 
 
 
290 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  40.36 
 
 
301 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  36.36 
 
 
286 aa  175  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 
281 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.32 
 
 
284 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  38.26 
 
 
295 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  38.95 
 
 
312 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  38.55 
 
 
289 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  38.81 
 
 
290 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  38.2 
 
 
312 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  35.5 
 
 
299 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  34.88 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.88 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.88 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  31.25 
 
 
285 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  31.6 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  30.45 
 
 
270 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  33.19 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  32.65 
 
 
258 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  32.07 
 
 
274 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  29.03 
 
 
266 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 
270 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 
266 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  32.05 
 
 
271 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.36 
 
 
277 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  30.29 
 
 
265 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  29.44 
 
 
266 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.25 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  31.25 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  31.38 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.75 
 
 
270 aa  99  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  31.15 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  30.04 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  30.66 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  30.96 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  29.05 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  28.57 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  29.71 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  30.98 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  29.15 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  30.29 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 
263 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  30.16 
 
 
273 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  31.02 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  29.88 
 
 
265 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  29.44 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>