141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1997 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 340 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  57.35 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  57.45 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  57.35 
 
 		 296 aa  311  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  57.35 
 
 		 296 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  56.1 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  56.41 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  55.75 
 
 		 298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  55.56 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  59.4 
 
 		 295 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  55.23 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  54.7 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  56.83 
 
 		 296 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  57.14 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  54.95 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  52.26 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  55.56 
 
 		 321 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  56.62 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  51.92 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  53.31 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  50.52 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  55.35 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  52.59 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  49.48 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  51.01 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  52.75 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  48.53 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  49.06 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  45.55 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  42.72 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  45.9 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  45.95 
 
 		 286 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  45.52 
 
 		 286 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  41.95 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  45.72 
 
 		 286 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  43.73 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  40.88 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  39.93 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  38.63 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  39.11 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  37.64 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  37.19 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  38.01 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  36.11 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  37.18 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  37.18 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  37.18 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  38.75 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  38.38 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.02 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.59 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  36.82 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  36.82 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  36.82 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  34.57 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  35.76 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  35.71 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  33.68 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  34.18 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 		 291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  30.49 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  30.67 
 
 		 266 aa  99.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  30.25 
 
 		 266 aa  95.9  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  32.92 
 
 		 270 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  31.15 
 
 		 270 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  28.99 
 
 		 266 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  32.37 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  31.56 
 
 		 266 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  31.66 
 
 		 273 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  32.14 
 
 		 274 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  32.64 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  29.28 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  30.74 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  28.15 
 
 		 267 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  28.63 
 
 		 266 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 		 270 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 288 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  29.29 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  28.51 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  26.45 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  28.57 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  27.73 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  27.35 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  28.24 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  29.29 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  29.22 
 
 		 267 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  32.79 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  28.15 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  29.55 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  27.57 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  27.16 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  29.72 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  30.24 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>