139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0386 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
287 aa  591  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  60.28 
 
 
286 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  60.28 
 
 
286 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  61.67 
 
 
286 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  56.64 
 
 
285 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  55.4 
 
 
286 aa  329  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  49.44 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  47.15 
 
 
297 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  45.49 
 
 
296 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  41.3 
 
 
298 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  44.04 
 
 
296 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
310 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  42.91 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  41.03 
 
 
295 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  48.32 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  42.6 
 
 
293 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  43.64 
 
 
296 aa  214  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  43.68 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  41.09 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  41.95 
 
 
340 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  41.26 
 
 
298 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  40.52 
 
 
293 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  40.85 
 
 
293 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  42.15 
 
 
298 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  42.15 
 
 
298 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  42.34 
 
 
293 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  41.09 
 
 
295 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  42.51 
 
 
314 aa  208  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  39.05 
 
 
295 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  39.38 
 
 
295 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 
295 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  40.82 
 
 
312 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  39.42 
 
 
296 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  39.42 
 
 
296 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  40.38 
 
 
295 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  39.84 
 
 
295 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  39.78 
 
 
296 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  35.59 
 
 
290 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  34.16 
 
 
296 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  33.57 
 
 
286 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  35.74 
 
 
289 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  34.16 
 
 
299 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  33.71 
 
 
285 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  35.77 
 
 
297 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  34.3 
 
 
292 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  35.32 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 
281 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  33.45 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  34.18 
 
 
302 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  34.55 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  34.18 
 
 
302 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.55 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  34.18 
 
 
302 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  34.18 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  32.46 
 
 
281 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  34.4 
 
 
290 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  34.1 
 
 
312 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  33.72 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  32.58 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  32.13 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 
284 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  33.71 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  32.85 
 
 
291 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  28.51 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  30.42 
 
 
267 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  30.67 
 
 
266 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  29.41 
 
 
267 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  30.17 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  29.17 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  28.41 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  26.64 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  27.92 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  25.79 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  26.59 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  28.57 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  27.85 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  29.48 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  31.03 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  25.45 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  27.07 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.45 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  28.74 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  26.35 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  27.08 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  27.51 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  28.9 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  27.8 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  27.5 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  29.96 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  29.58 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  27.38 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  28.4 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  29.55 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  26.92 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>