143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5029 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 267 aa  550  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  96.63 
 
 		 267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  91.01 
 
 		 267 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  80.52 
 
 		 267 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  74.81 
 
 		 266 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  72.45 
 
 		 266 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  72.45 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  71.7 
 
 		 266 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  70.94 
 
 		 266 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  63.3 
 
 		 269 aa  354  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  62.55 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2223  N-formylglutamate amidohydrolase  59.62 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0797472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2114  N-formylglutamate amidohydrolase  59.62 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2513  N-formylglutamate amidohydrolase  59.23 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4550  N-formylglutamate amidohydrolase  56.6 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  55.13 
 
 		 266 aa  291  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  54.37 
 
 		 266 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  52.67 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  51.15 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  50.94 
 
 		 274 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  49.24 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  49.62 
 
 		 274 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  50.79 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2850  N-formylglutamate amidohydrolase  49.05 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  49.43 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  50 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.87 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  50.58 
 
 		 270 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  49.22 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  48.83 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  50.78 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  48.65 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  50.99 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  49.06 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  48.68 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  51.52 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  46.62 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  47.47 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  47.08 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  47.08 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  47.47 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  47.47 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  46.51 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  47.08 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  46.09 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  41.89 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  44.57 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  44.94 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  45.14 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  45.14 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  45.91 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  44.92 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  45.82 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  44.03 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  45.49 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  43.45 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  44.76 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  42.86 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  42.02 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  44.81 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  42.19 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  42.25 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  42.18 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  39.08 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  29.29 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  31.44 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  31.18 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  31.12 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  28.63 
 
 		 298 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  30.96 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  30.82 
 
 		 295 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  30.77 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  29.53 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  30.49 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  29.77 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  30.49 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  29.06 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  30.6 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  29.76 
 
 		 312 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  29.76 
 
 		 312 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  25.94 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  29.86 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  27.06 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  26.01 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  29.83 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  30.45 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  27.57 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>